ปัจจุบันโรงพยาบาลสัตว์บางกอกมีแผนกต่าง ๆ เปิดให้บริการ  24 ชั่วโมง ดังนี้

 1. แผนกอายุรกรรม

 2. แผนกคลินิกพิเศษ
     2.1 โรคตา
     2.2 โรคระบบหัวใจและหลอดเลือดคัดกรองด้วยเครื่องคลื่นไฟฟ้าหัวใจ/คลื่นเสียงอัลตร้าซาวด์
     2.3 โรคผิวหนัง 
     2.4 โรคช่องปากและฟัน ขูดหินปูน ขัดฟัน กรอฟัน อุดฟัน2
     2.5 โรคกระดูกและข้อ
     2.6 โรคระบบทางเดินปัสสาวะ / ไต
     2.7 โรคเบาหวาน – ต่อมไร้ท่อ 
     2.8 เนื้องอก และมะเร็ง             
     2.9 คลินิกสัตว์เลี้ยงพิเศษ( EXOTICS  PET) 
     2.10 คลินิกกายภาพบำบัด/ธาราบำบัด/เลเซอร์บำบัด                      

3. แผนกศัลยกรรม
ผ่าตัด-ทำหมัน / ศัลยกรรมกระดูกและข้อต่อ เนื้อเยื่อ โดยเครื่องดมยาสลบ

4. แผนกสูติกรรม
ตรวจหาระยะเป็นสัด หาวันผสม ผสมเทียม กำหนดวันคลอด ผ่าคลอด

5. แผนกรังสีวินิจฉัย/CT SCAN และอัลตร้าซาวด์ 4 มิติ

6. แผนกสัตว์ป่วยฉุกเฉิน
ER/ICU/ถ่ายเลือด

7. แผนกสัตว์ป่วยใน
7.1ห้อง VIP ห้องพักพิเศษสำหรับสัตว์เลี้ยง
7.2ห้อง ICU ห้องพักสำหรับสัตว์ป่วยภาวะวิกฤต
7.3ห้อง SCU ( Special Care Unit )ห้องพักสำหรับสัตว์ป่วยที่ต้องการการดูแลอย่างใกล้ชิดตลอด 24 ชั่วโมง
7.4ห้องพักสำหรับสัตว์ป่วย ติดเชื้อด้วยโรคติดต่อของระบบทางเดินหายใจและระบบทางเดินอาหาร
7.5 ห้องพักสัตว์ป่วยทั่วไป และรับฝากเลี้ยง

8.แผนกอุปกรณ์สัตว์เลี้ยง

9. แผนกอาบน้ำตัดขน

10. บริการเพิ่มเติม
10.1ศูนย์ติดตั้งบัตรประจำตัวสัตว์ อิเล็กทรอนิกส์ (Microchip : Animal Identification)
10.2 บริการตรวจสุขภาพสัตว์เลี้ยง กรณีเดินทางออกต่างประเทศ (Health Certification)
10.3 บริการรถรับส่งสัตว์เลี้ยง บริการนอกสถานที่